3 июля, 2021 
AdminGWP 
Укрaинскиe учeныe изо Институтa мoлeкулярнoй биoлoгии и гeнeтики НAН Укрaины прoвeли мaсштaбнoe исслeдoвaниe микрooргaнизмoв стoличнoгo мeтрoпoлитeнa.
Кaк пeрeдaeт Укринфoрм, oб этoм Альма-матер мoлeкулярнoй биoлoгии и гeнeтики НAНУ сooбщил в Фeйсбукe.
"В дoпoлнeниe к уникaльным микрoбным прoфилям в рaзныx гoрoдax aнaлиз выявил oснoвнoй нaбoр 31 видa микрooргaнизмoв, нaйдeнныx в 97% oбрaзцoв. Исслeдoвaтeли выявили 4246 извeстныx видoв микрooргaнизмoв, нo oднoврeмeннo — 10928 нoвыx вирусoв и 748 бaктeрий. Oткрытиe нoвыx видoв может помочь в построении филогенетических деревьев, для того чтоб понять, как разные цель микроорганизмов связаны между из себя", — говорится в сообщении.
В Институте отмечают, яко выводы исследования имеют большой потенциальных практических применений, в основе данных секвенирования были найдены сильнее 800 тыс. новых массивов CRISPR (методика редактирования геномов). Кроме того, выводы указывают держи наличие новых антибиотиков и малых молекул, ассоциированных с биосинтетическими генными кластерами (biosynthetic gene clusters, BGC), которые имеют жизненные) резервы в области разработки новых лекарств.
Одним с следующих шагов является целостность и проверка некоторых из сих молекул и прогнозируемых BGC медицински и терапевтически.
Руководителем проекта с Украины является младший ученый сотрудник ИМБГ Алина Фролова изо группы системной биологии.
«Как же, в киевском метро мы выявили весть типичного представителя кожной микрофлоры человека — сutibacterium acnes, подобно как в норме обычно наблюдается у здоровых людей. Сия бактерия входит в состав основных 31 вида, найденных кайфовый всех 60 городах, и всё ещё раз свидетельствует об огромном влиянии человека для городскую среду. Однако выявлены и планы на будущее, которые уникально характеризуют киевское метрополитен, например, Mycobacterium sp. VKM Ac-1817D — палочка, впервые секвенированнеая в 2015 году. Сие непатогенная микобактерия, которая может применять деструкцию природных стеринов с образованием андростанов, которые являются ключевыми промежуточными веществами в целях синтеза фармацевтических стероидов. Сие не значит, что каста бактерия присутствует в больших количествах, иль мы сразу можем ее эксплуатировать с биофармацевтической целью, однако нащупывание и выявление новых бактерий с похожими свойствами обладает огромным потенциалом», — рассказывает изыщик.
Как сообщили в Институте, расчёт начался в 2013 году, порой глава консорциума MetaSUB, гелертер медицины в Weill Cornell (WCM) Кристофер Мэйсон начал оброк и анализ образцов микробов в метрополитене Нью-Йорка. В 2015 году за инициативе ученого был создан Мировой консорциум MetaSUB (сокращение с Metagenomics and Metadesign of Subways and Urban Biomes), каковой охватил не только исследование микробиомов на твердых поверхностях, хотя и в образцах городского воздуха, воды и сточных вод. Унигард присоединился к проекту в 2017 году.
Каждогодно 21 июня MetaSUB проводит повальный сбор образцов по всему миру (Global City Sampling Day). Образцы собирают с через стерильных свабов, которые без- содержат ДНК и РНК, и отправляют в лабораторию WCM пользу кого централизованного выделения генетического материала и секвенирования дружно с положительным и отрицательным контролями. Полногеномное секвенирование позволяет осматривать весь состав организмов, генетический материя которых попал в образец, ровно как раз и является объектом исследования метагеномики.
Междунациональный консорциум MetaSUB опубликовал результаты сего глобального исследования в Cell.
(как) будто сообщал Укринформ, Кабинет Министров установил строй использования средств для создания бери базе Института молекулярной биологии и генетики НАН Украины специализированной лаборатории во (избежание работы с инфекционными материалами.
Отпечаток: @IMBGNASU
Опубликовано в рубрике